Народився 26 липня 1959 р. в с. Олексіївка Яготинського району Київської обл. Закінчив Білоцерківський сільськогосподарський інститут за спеціальністю «агрономія». Кандидат філософських наук.
1981-1983 рр. - агроном радгоспу «Сад Поділля» (Шаргородський район Вінницької обл.).
У 1983-1984 рр. Володимир Хоменко працював другим секретарем Шаргородського райкому комсомолу.
1984-1985 рр. - старший агроном радгоспу «Сад Поділля», агроном з захисту рослин радгоспу «Жовтневий» (Васильків, Київська обл.).
1985-1986 рр. - бригадир, старший агроном мехзагону, заступник голови об'єднання - старший агроном-агрохімік районного ВО «Сільгоспхімія» (Бровари, Київська обл.).
У 1986-1997 рр. Володимир Хоменко працював інструктором сільськогосподарського відділу Броварського міськкому КПУ, директором відгодівельного радгоспу ім. Кірова (с. Зазим'я Броварського району), реорганізованого в КСП «Нова Україна». Паралельно, в 1990-1994 рр. - депутат ВР I скликання.
1997-1999 рр. - голова Броварської райдержадміністрації.
1999-2002 рр. - начальник Державної податкової служби в Київській обл.
2002-2005 рр. - заступник та начальник управління у Державному управлінні справами під керівництвом Ігоря Бакая.
2005-2007 рр. - заступник, перший заступник голови Державного управління справами Ігоря Тарасюка.
10 липня 2007 р. Володимир Хоменко призначений в.о. голови Чернігівської облдержадміністрації. 12 липня 2007 р. - призначений головою Чернігівської ОДА.
20 квітня 2010 р. Володимир Хоменко перепризначений головою Чернігівської ОДА. Депутат Чернігівської облради VI скликання.
Нагороджений орденом «За заслуги» всіх трьох ступенів. Заслужений працівник сільського господарства України.